Kjersti Haugen er utdannet ved École Internationale de Théâtre Jacques Lecoq i Paris, Drama og teater ved NTNU og regilinja på Statens Teaterhøgskole (KHiO).
Kjersti er bosatt i Trondheim og har satt opp en rekke forestillinger ved Trøndelag Teater, blant annet Spring Awakening, Fedra, Jeanne d’Arc, Den hemmelige hagen, Romeo og Juliet, Der det finst fuglar, Så som i himmelen, de fire Ibsen-forestillingene Et dukkehjem, Gjengangere, Hedda Gabler og Lille Eyolf og Heddaprisvinneren Hundre hemmeligheter. Ved andre teatre har hun regissert blant annet Den lille prinsen (Nationaltheatret), Hunden i høyet (Hålogaland Teater), Verdas mest forelska par (Det Norske Teatret), Askeladden og de gode hjelperne (Den Nationale Scene), Mine venner (Riksteatret), Farfarfortellinger (Turnéteatret i Trøndelag), Klasserommet (Cirka Teater) og Et juleeventyr (Aalborg Teater), Isbjørnpappaen (Rosendal Teater), Tåkefall (Rogaland Teater).
Ved Teater Innlandet var Kjersti aktuell som dramatiker og regissør for Stille inn våren 2025. For forestillingen ble Haugen våren 2026 nominert til Den nasjonale Ibsenprisen 2026.